Formó parte de una coqueta y provinciana plaza, junto con el Teatro López de Ayala, el Hospital de San Sebastián, Casino Militar y el Seminario de San Atón, aspecto que mantuvo hasta 1962.

La edificación original data des siglo XIV, cuando casi toda la manzana y el Paseo de San Francisco formaba parte del Convento de esto nombre. En 785 se reestructura la iglesia, erigiéndose una nueva iglesia a expensas del rey Juan V de Portugal, al objeto de conmemorar la boda de su hija Bárbara de Braganza con heredero de la corona española.

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